c:\test>junk46
>>HWI-EAS158_40_3_1_46_535
AATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTG
>HWI-EAS158_40_3_1_47_579
GTGAATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTGACAAA
GTGAATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTGACAAA
GTGAATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTGACAAA
GTGAATGCGTGATACAGGAATGTTCGTT
>HWI-EAS158_40_3_1_46_731
TCATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTGAAAAGTG
TCATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGTGAAAAGTG
TCATGCGTGATACAGGAATGTTCGTTGT